Сюжет дорамы «Шпион» рассказывает о Пак Хе-рим, обычной домохозяйке с идеальной семьей — мужем и двумя детьми. Но под этим внешним образом скрывается шпионка из Северной Кореи, которая много лет назад была внедрена в Южную Корею. Жизнь Пак Хе-рим резко меняется, когда она получает приказ вернуться на родину и привести с собой своего сына, хладнокровного и выдающегося аналитика по Северной Корее, работающего на Национальную службу разведки Южной Кореи. Перед ней встает страшный выбор: предать любимого сына или вернуться на родину, рискуя потерять всё, что она построила в новой жизни.